リファレンス
Stdクラス StopFlagプロパティ
アドインプログラムをユーザーのボタン操作により停止させる手段として用意されています。
実行ボタンでStopFlagがFalseにセットされ、アドインプログラムがコールされます。停止ボタンを押すとStopFlagがTrueにセットされますのでアドインプログラム内で条件分岐により停止させて下さい。
この仕組みを記述しないまま無限ループを作成した場合は停止する術が無く、タスクマネージャー等でサイトロジーをKillするしかなくなります。
使用法
Dim instance As Std = New Std()
Dim returnValue As Boolean

returnValue = instance.StopFlag
使用例
'Stdクラス プロパティ StopFlag

Imports System.Windows.Forms

Public Class AddIn

	Private std As Std

	Public Sub New()
		std = New Std()
	End Sub

	Public Sub AddIn_Start()
		Dim num As Integer = 0
		Do While True
			If std.StopFlag Then Exit Do
			MessageBox.Show(num.ToString())
			System.Threading.Thread.Sleep(2000)
			Application.DoEvents
			num += 1
		Loop
		MessageBox.Show("停止しました")
	End Sub

End Class
使用例
System.Threading.Thread.Sleepではなく、StdFuncクラスのWaitMilliSecメソッドを使用する事でより安全にご使用いただけます。 
'Stdクラス プロパティ StopFlag

Imports System.Windows.Forms

Public Class AddIn

	Private std As Std
	Private stdf As StdFunc

	Public Sub New()
		std = New Std()
		stdf = New StdFunc()
	End Sub

	Public Sub AddIn_Start()
		Dim num As Integer = 0
		Do While True
			If std.StopFlag Then Exit Do
			MessageBox.Show(num.ToString())
			stdf.WaitMilliSec(1000)
			num += 1
		Loop
		MessageBox.Show("停止しました")
	End Sub

End Class